1、保守药物治疗：服用药物，大量饮水，调节尿液pH值，控制饮食种类等方法。适合于尿酸盐及胱氨酸结石以及结石直径小于0.4cm的患者。

2、体外碎石：体外冲击波碎石术对人体造成的损伤小、可逆，不用介入体内，避免了开刀创伤，适合于直径小于0.5-1cm的结石，并且容易击碎的结石。肾脏结石现多不主张碎石。

3、手术治疗分为：传统开发式手术治疗和微创技术治疗。

(1)传统开发式手术：

肾盂切开取石术：适用于肾内型肾盂结石、肾外型肾盂内较大结石和肾外型肾盂结石伴有肾盏内结石及其肾盏漏斗部有明显扩张者。

肾实质切开取石术：适用于鹿角形肾盂肾盏结石或肾盏内的多发结石、经肾盂无法取出或不易取净的结石。为了减少出血，一般选择在肾实质最薄的部位或离结石最近的部位切开肾实质。必要时还要采取暂时阻断肾脏血流、局部降温的方法来减少出血。

肾部分切除术：对于局限于肾上盏或肾下盏的多发结石、特别是肾盏颈部有狭窄时，采用肾切开取石或肾盂切开取石都不能顺利取出结石时，可行肾部分切除术，将肾上极或肾下极连同结石一并切除。

肾切除术：对一侧肾或输尿管结石梗阻引起的严重肾积水，肾皮质菲薄;合并感染并导致肾积脓，肾功能完全丧失者。如果对侧肾功能正常，可施行肾切除手术。

(2)微创技术治疗：

根据不同病情选用纤维软性肾镜取石和经皮肾镜取石。现90%左右的肾结石手术已不再采用传统的开放式手术治疗，多采用纤维软性肾镜取石术。不开刀，微创治疗。