睾丸扭转基于精索发生扭转，可发生于3个部位，原因有扭转发生于固有鞘膜之外，新生儿多数属此型，睾丸及鞘膜均发生梗死。发生于鞘膜内多见于青年，睾丸系膜过长可能是诱因。扭转位于睾丸与附睾之间，与二者间结合不完全有关。

睾丸扭转的发病机制尚不十分清楚，可能为数种因素同时致病。睾丸鞘膜和精索的发育异常是睾丸扭转的主要原因，Cass（1982）观察到，几乎所有的患者均存在易致睾丸扭转的解剖变异。提睾肌痉挛是睾丸扭转的始发原因，从解剖上看，提睾肌呈斜形或螺旋形分布于精索，当提睾肌收缩时，使睾丸由外侧向内侧旋转，故发生睾丸扭转时，左侧为逆时针旋转，右侧为顺时针旋转。与遗传有关。特发性睾丸梗死（idiopathicinfarctofthetesticle）不伴精索扭转，常伴发于小婴儿时期绞窄性或嵌顿性腹股沟疝，也见于臀产产伤后，有些病例出生后就有睾丸梗死，可能是宫内扭转后自然复位。病理改变睾丸扭转后，发生的病理改变与扭转程度及缺血时间密切相关。